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SARS

Jul 23, 2023Jul 23, 2023

Nature Reviews Microbiology volume 21、pages 147–161 (2023)この記事を引用

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メトリクスの詳細

SARS-CoV-2 ウイルス量と気道における感染性ウイルスの検出は、感染性を推定するための 2 つの重要なパラメーターです。 感染性ウイルスの排出はその後の伝播に必要であるため、排出の特徴を理解することは公衆衛生介入に関連します。 ウイルスの排出は、ウイルスの生物学的特性、宿主要因、および感染者の既存の免疫(以前の感染またはワクチン接種)によって影響されます。 人から人への感染のプロセスは多因子ですが、ウイルス量が人から人への感染に大きく寄与しており、ウイルス量が高いほど、さらなる感染のリスクが高まります。 懸念される新たな SARS-CoV-2 変異種により、ウイルス排出の状況はさらに複雑になっています。 過去の感染、ワクチン接種、またはその両方の組み合わせによる人口の基礎的な免疫は、パンデミックから約 3 年後に世界規模で急速に増加しており、ウイルス排出パターンは祖先型 SARS-CoV-2 のパターンとはより明確になってきています。 感染性ウイルスの排出に影響を与える要因とメカニズム、および SARS-CoV-2 に感染した個人が伝染する期間を理解することは、公衆衛生対策を導き、感染を制限するために重要です。 さらに、日常的な診断検体から感染性ウイルスの存在を証明するための診断ツールが必要です。

2019年末、新型コロナウイルスが出現し、後に重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)と呼ばれ、2019年コロナウイルス病(COVID-19)の原因物質となった。 SARS-CoV-2 は主に上気道 (URT) の多繊毛細胞を標的としますが、URT1 以外の細胞にも感染することが報告されています。 それは下気道(LRT)に広がり、そこで肺胞に感染し、ガス交換の低下、炎症、新型コロナウイルス感染症に典型的な肺の病状を引き起こす可能性があります(参考文献2)。 感染した人は URT を介してウイルスを放出し、感染性ウイルスの放出により二次感染が起こり、ウイルスがさらに拡散します。

SARS-CoV-2 感染症は臨床症状が非特異的であるため、SARS-CoV-2 感染を特定するには正確な診断ツールが必要です。 ウイルスの出現後、特異的リアルタイム PCR (RT-PCR) アッセイがすぐに利用可能になり、その後、抗原検出 (迅速) 診断検査 (Ag-RDT) および血清学的アッセイが続きました。 RT-PCR による呼吸器検体中のウイルス RNA の検出は高感度かつ特異的ですが、複製能力のあるウイルスと残留 RNA を区別することはできません。 診断検査がない場合、感染性は 2 つの指標のいずれかを使用して確立されることがよくあります。定義されたサイクル閾値 (Ct) 値を超えるウイルス RNA の存在、または Ag-RDT 陽性です。 RT-PCR は初期診断に有用なツールですが、Ag-RDT は隔離期間を終了するための指標として機能します。 これは、ウイルス RNA (RT-PCR で検出される) は感染性ウイルスの非存在下でも検出可能なままであるのに対し、Ag-RDT の陽性は感染性ウイルスの存在とよりよく相関するためです。

気道以外に、SARS-CoV-2 RNA は末梢血、便、尿、眼分泌物からも検出されています3、4、5、6、7。 非呼吸器検体からのウイルス分離はほとんどの研究で成功せず 4,8,9 、非呼吸器検体に感染性ウイルスが存在する報告例はほとんどありません 10,11,12,13。 さらに、気道サンプルからのウイルス量は他の物質よりもはるかに高いことが判明し、後者には感染性ウイルスの存在と適合しない RNA ウイルス量が含まれることがよくあります。 このような検体は感染に関連するとは考えられないため、我々は気道を介した SARS-CoV-2 ウイルスの排出のみに焦点を当てています。

50 years of age61. According to one study, viral RNA can be detected for longer times in male patients infected with ancestral SARS-CoV-2 (ref.102), and RNA viral loads were elevated in male patients infected with either Alpha or Delta variants compared with female patients88. However, a possible association of viral load dynamics with age or sex is highly debated, as other studies demonstrated that they have no influence on infectious virus25 or RNA viral loads59./p>106 genome copies per millilitre, which corresponds largely with a Ct of 25 in most RT-PCR assays4, indicating that Ag-RDT is a good proxy for infectiousness177. However, the obvious limitations of Ag-RDT, such as lower sensitivity of infectious virus detection towards the end of infection47,52, should not be neglected. Ag-RDTs have also shown variation in their sensitivity and specificity for detection of SARS-CoV-2 VOCs53,54, which is a challenge as new variants emerge./p>